柬埔寨的熱帶雨林深處，隱藏著一群神秘的古老寺廟，它們被稱為吳哥窟。
　　
　　吳哥窟在吳哥王朝崩潰后被埋沒在荒野之中四百多年，讓全世界都遺忘了它的存在。直到1860年，法國博物學家歐姆在密林中探索時，發現了它們，吳哥窟才得以重見天日。
　　
　　但是人們很快發現，熬過歷史滄桑、戰火摧殘的吳哥窟，正在卷入另一場可怕的糾纏之中。
　　
　　許多寺廟，都被古樹纏繞著，巨大的熱帶樹木，用巨蟒一樣的根系緊緊地纏繞著廟墻寺塔，有些古樹騎跨在圍墻上，盤根錯節，蜿蜒攀附。墻體與古樹一起傾斜，崩裂，看似搖搖欲墜，卻又勾連鎖系，形成一種微妙特殊的共生關系。但是，隨著樹木的不斷生長，在不久的將來，這些寺廟將會被擠壓得坍塌成一堆堆石塊。
　　
　　為了保護這些珍貴的世界遺產，世界許多國家都派出文物修復專家搶救吳哥窟。但是樹木與建筑既相互依存又相互威脅的現狀，讓這些想保存吳哥窟榮耀的專家們備感棘手：如果要清理掉建筑中的樹木，寺廟就會倒塌，因為樹木的根莖是維系吳哥窟多處斷壁殘垣的唯一憑借，如果不清理這些樹木。照此發展下去，樹木的生長會不斷擠壓早已搖搖欲墜的脆弱建筑，用不了多久，它們就會摧毀這座千年古跡。
　　
　　文物專家們沒有辦法改變這些寺廟的現狀，而只能修剪一下這些樹木，但有一點可以肯定，無論人類怎么做，吳哥窟終會倒下，而它們的位置將會被樹木取代。無法改變的殘酷現實，讓為這些藝術瑰寶心醉的人心碎。
　　
　　如果將時光倒退到一千多年前，我們將會看到另一番畢生難忘的畫面。這里沒有建筑，因為這是南亞最大的一片熱帶雨林，各種樹木，蔥蘢茂密，生機勃勃，競相生長，構建著一片寧靜而和諧的綠色王國。直到有一天，人類的足跡出現在這里，他們用刀斧，用火，蠻橫地將一棵棵大樹砍倒、燒死，最終，一片片森林被燒成灰燼，夷為平地。然后，許多巨石從別處運來，在上百年的時間里，一座又一座寺廟在森林的心臟地帶挺起。最終，一座座令人嘆為觀止的世界奇跡產生了。
　　
　　建筑者們不曾想到，那些被砍倒的樹木，并沒有屈服于人類的屠刀烈火，它們將屈辱與憤怒的根須深深埋在地下，等待機會破土而出，收復自己的家園。接下來，在一場關于時間和耐力的比拼中，人類的文明開始屈服于自然。吳哥王朝覆滅后，吳哥窟被遺棄，樹木的進攻由此拉開了序幕，一點點的蠶食和瓦解，讓這些“占領者”崩塌，破碎，走向毀滅。
　　
　　先進的科技，精湛的工藝，只能暫時延緩吳哥窟衰敗的速度，在強大的自然力量面前，誰也挽救不了它們。
　　
　　吳哥窟與樹的故事，告訴人類如何與自然相處：向自然進攻，與自然為敵，最終必會敗給自然。只有順應自然，與自然和諧共處，我們才會得享自然給予的潤澤與饋贈。